Редкие рукописи и старинные книги на азербайджанском, турецком, узбекском, арабском, персидском и других языках составляют золотой фонд хранилища Института рукописей имени Мухаммеда Физули Национальной академии наук Азербайджана. Сегодня здесь собрано более 40 тысяч рукописных и старопечатных изданий.
Основу фонда рукописей по медицине и астрономии, математике и минералогии, поэзии и философии, теологии и юриспруденции, грамматике и истории, географии и художественной прозе составили библиотеки, личные коллекции и собрания сочинений Аббасгулу ага Бакиханова, Мирзы Фатали Ахундова, Абдулгани эфенди Халисагарызаде, Гусейна эфенди Гаибова, Бахман Мирзы Гаджара, Мир Мохсуна Навваба и других представителей азербайджанской интеллигенции XIX–XX веков.
Манускрипты, переписанные с IX по XX век, хранят сочинения классиков восточной литературы, труды средневековых математиков, астрологов, путешественников, врачей, а также произведения великих поэтов.